媽祖生平有許多傳說，據《天后志》記載的有十五則，據《天妃顯圣錄》記載的有十六則。它們分別是：
A:萊嶼長青: 湄洲島旁邊有一個小嶼，傳說有一天，媽祖到小島上游玩時將菜子撒在地上，不久菜子奇跡般成長，花開滿地。隨后，每年無需耕種，自然生長。當地人視仙花采之。以后，人們就把這個地方稱為"菜子嶼"。
B:禱雨濟民: 相傳媽祖二十一歲的時候，莆田地方出現大旱，全縣百姓都說非媽祖不能救此災害。于是，縣尹親往向媽祖求救，媽祖祈雨，并說壬子日申刻就會下大雨。到了那天，上午晴空無云，絲毫沒有要下雨的征兆，申刻一到，突然烏云滾滾，大雨滂沱而下，久旱遇甘雨，大地恢復往日生機。
C:掛席泛槎: 相傳媽祖在世時，有一天，海上起風浪，媽祖要渡海，岸邊船只是有，但是船上沒有船槳，也沒有船篷，加上風急浪大，船手不敢開船，媽祖對船手說：你只管起船。隨即叫人將草席掛在桅桿上用作船帆。船開上海面，乘風破浪，飛弛而去。
D:化草救商: 相傳媽祖在世時，湄洲嶼西邊有個出入湄洲的要沖叫門夾（就是今天的文甲），有一次，一艘商船在附近海上遭到巨風襲擊觸礁，海水涌進船艙，即將沉沒，村民見狂巨浪，不敢前去營救。在這緊急時刻，媽祖信手在腳下找了幾根小草，扔進大海，小草變成一排大杉劃到并附在即將沉沒的商船上，商舟免遭沉沒，船中人免難。
E:降伏二神: 相傳在媽祖二十三歲時，湄洲西北方向有二神，一為順風耳，一為千里眼。二神經常出沒貽害百姓。百姓祈求媽祖懲治二神。為了降服二神，媽祖與村女們一起上山勞動，這樣，一直過十多天，二神終于出現了，當二神將近時，媽祖大聲呵斥，二神見媽祖神威，化作一道火光而去，媽祖拂動手中絲帕，頓時狂風大作，那二神弄不清所以，持斧疾視，媽祖用激將法激二神丟下鐵斧，丟下鐵斧之后二神再也收不起鐵斧，于是認輸謝罪而去。兩年后，二神海上再次作崇，十分厲害，媽祖用神咒呼風飛石使二神無處躲避，二神服輸，愿為媽祖效力，于是媽祖收二神為將。
F:解除水患: 相傳媽祖二十六歲時，那年上半年，陰雨連綿，福建與浙江兩省倍受水災之害。當時當地官員上奏朝廷，皇帝下旨就地祈雨，但祈求毫無改觀。當地請求媽祖解害，媽祖道：災害是人積惡所致，既然皇上有意為民解害，我更是應當祈天赦佑。于是焚香禱告，突然天開始起大風，并見云端有虬龍飛逝而去，天空晴朗了。那一年百姓還獲得了好收成，人們感激媽祖，省官于是向朝廷為媽祖請功并準得到褒獎。
G:救父尋兄: 相傳媽祖十六歲那年秋天的一天，其父兄駕船渡海北上之際，海上掀起狂風惡浪，船只遭損，情況危急。這時媽祖在家織布，忽然閉上眼睛，使勁全力扶住織機，母親見狀，忙叫醒她，媽祖醒來時失手將梭掉在了地上，見梭掉在了地上，媽祖哭道：父親得救，哥哥死了！不久有人來報，情況屬實。兄掉到海里后，媽祖陪著母親駕船前去大海里尋找，突然發現有一群水族聚集在波濤洶涌的海面，眾人十分擔心，而媽祖知道是水族受水神之命前來迎接她，這時海水變清，其兄尸體浮了上來，于是將尸體運回去。此后每當媽祖誕辰之日，夜里魚群環列湄嶼之前，黎明才散去，而這一天也成為當地漁民的休船之日。
湄洲祖廟媽祖像
H:懇請治病: 相傳媽祖在世時，有一年，莆田瘟疫盛行，縣尹全家也染上了疾病，有人告知縣尹媽祖有解難之法力。于是，縣尹親自拜請媽祖，媽祖念他平時為官不壞，加上他是外來官，告訴他用菖莆九節煎水飲服，并將咒符貼在門口。縣尹回去后遵囑施行，不日疾病痊愈。
I:收伏二怪: 相傳媽祖在世時，湄洲有嘉應和嘉佑二怪，經常出沒害民。有一天，一位船客遭怪物作怪，船將沉沒。媽祖見之即化作一貨船，前去救難。嘉佑見貨船前來，立即來追貨船。媽祖口念神咒，將其制服。嘉佑當即叩首服罪，媽祖將其收入水闕仙班。為制服嘉應，媽祖施計，于山路獨行，嘉應以為只是民間美女，便起歹心前來觸犯，媽祖一揮塵拂，嘉應見之不妙逃去。時隔一年，嘉應又出來為害百姓，媽祖說："這個怪物不歸正道，必然擾害人間。"于是叫村民帶符焚香齋戒，自己則乘小舟，到海上出其不意，降服嘉應。媽祖也將嘉應收為水闕仙班一員。
J:窺井得符: 相傳媽祖十六歲的時候，有一次，與一群女伴出去游玩，當她對著井水照妝時，一位后面跟著一班神仙的神人捧著一雙銅符，擁井而上，把銅符授給她，一起玩得女伴們都嚇跑了，而媽祖則接受銅符，并不懷疑。媽祖接受銅符后，靈通變化，符咒避邪，法力日見神通，以至她常能神游，騰云渡海，救急救難，人門稱她是"神姑"，"龍女"。
K:媽祖誕降: 媽祖父親林惟愨（諱愿），母親王氏，二人多行善積德。惟愨年四十多歲時，已生有一男五女。但擔憂一子難保傳宗接代，所以經常焚香禱告，想再生一個兒子。惟愨夫婦的虔誠感動了南海觀音，一天晚上，觀音托夢給王氏并對王氏說："你家行善積德，今賜你一丸，服下當得慈濟之賜。"不久王氏便懷孕了。北宋建隆元年（960年）三月二十三日傍晚，王氏分娩時，西北處一道貌岸然紅光射入屋中，并伴有隆鳴之聲，媽祖降生了。因媽祖是女孩，父母非常失望，但媽祖生得奇異，因此十分疼愛。媽祖從出生到滿月，一聲不哭，所以，其父母給她取名林默。相傳媽祖誕生在湄洲島。
L:湄嶼飛升: 宋太宗雍熙四年，媽祖時年二十八歲，重陽節的前一天，對家人說："我心好清凈，不愿居于凡塵世界。明天是重陽佳節，想去爬山登高。預先和你們告別。"家人都以為她要登高遠眺，不知將要成仙。第二天早上，媽祖焚香誦經之后，告別諸姐，一人直上湄峰最高處，這時，湄峰頂上濃云重重，媽祖化作一道白光沖入天空，乘風而去。此后媽祖經常顯靈顯圣，護國佑民，救人危難，當地百姓感激她，在湄峰建起祠廟，虔誠供奉。據傳祖廟后的摩崖"升天古跡"處就是媽祖飛天的地。
M:驅除怪風: 相傳媽祖在世時，湄洲對面吉蓼城西面，有一座跨海石橋，是當地百姓南來北往的要道。有一天，忽然怪風刮起，刮斷了全部橋樁，一時交通斷絕，人們無法過往。百姓以為是風神所為，于是祈求媽祖解難。媽祖到石橋處察看，見遠處天空一道黑氣，知道是有怪所為，于是施展靈術將怪驅逐遠去，從此石橋通暢無害。
N:收伏晏公: 相傳媽祖在世時，海上有一怪物叫晏公，時常在海上興風作浪，弄翻船只。有一天，媽祖駕船駛到東部大海，怪物又開始興風作浪，媽祖乘坐的船只搖晃的非常厲害。媽祖即令拋錨，見前方波濤中一舟上有一金冠繡袖、掀髯突睛之神在作怪。媽祖不動聲色，掀起狂風巨浪與之抗擊，晏公害怕媽祖的神威，叩拜蕩舟離去。但怪物一時為法力所制有所不服，于是變成一條神龍，繼續興風作浪，媽祖說到："此妖不除，風波不息"，在中游拋錨，制服神龍。媽祖命令晏公統領水闕仙班（共有十八位），護衛海上船民，后來晏公成為媽祖部下總管。
O:收高里鬼: 相傳媽祖在世時，有一個叫高里的地方出了一個妖怪，當地百姓受其害，染上百病，當地百姓前去求媽祖醫治，媽祖給求治者一符咒，叮囑百姓回去后，將符咒貼于病人床頭上。妖怪知符咒法力巨大，于是變成一只鳥逃去，媽祖追出，見鳥藏在樹上，鳥嘴還噴出一團黑氣，媽祖口中念到："此怪物不能留此，為患鄉里"，追擊并將鳥抓獲。原來是一只鷦鷯，媽祖用符水噴灑小鳥，小鳥落地變成一撮枯發，媽祖取火燒之，枯發現出小鬼原相。小鬼忙叩請媽祖收留，媽祖于是將它收在臺下服役。
P:鐵馬渡江: 相傳有一天，媽祖要渡海，可是沒有船只，這時候，媽祖見旁邊屋檐前懸有鐵馬，于是靈機一動，取之揮鞭，鐵馬奔海對面風馳而去，待人上了對岸，忽然之間，鐵馬無影無蹤，旁邊的人無不驚嘆"龍女"的神通廣大。
媽祖顯靈傳說之一：甘泉濟師
據記載康熙二十一年十月，清軍水師提督施瑯奉旨率三萬水兵駐扎平海，等待乘風東渡臺灣。當時正遇到干旱，軍中缺水。平海天后宮旁有一被填廢井，施瑯命令挖掘，并暗向媽祖祈禱，井挖好后泉水甘口，解了老百姓、兵士用水之難，泉水從此不竭。施瑯以為這是神賜甘泉濟師，親書"師泉"二字，此井至今仍存。
媽祖顯靈傳說之二：佑助收艇
傳說康熙二十一年十二月二十六日夜，施瑯第一次率兵渡海攻打臺澎，因缺風船行很慢，施瑯下令回航平海。不久，忽起大風，戰艦上小艇被風刮下海，不知去向。第二天風停息后，命令出海尋找小艇，均安然停在湄洲灣中，艇上人報告說：昨夜波浪中見船頭有燈光，似人攬艇，是天妃默佑之功。施瑯大為感動，命令整修平海天后宮，重塑媽祖神像，捐重金建梳妝樓、朝天閣，并請回媽祖神像一尊奉祀在船上。
媽祖顯靈傳說之三：澎湖助戰
傳說康熙二十二年六月，施瑯第二次率兵東渡攻打澎湖，軍中士兵感到神妃在左右助戰，個個英勇向前，千總劉春夢天妃告之二十一日必克澎湖，七月必克臺灣。后來清兵強攻澎湖七晝夜，并臺灣統一。當時清兵出戰攻澎之日，媽祖派千里眼、順風耳二神將助戰，即媽祖"澎湖助戰"的神話故事。
媽祖顯靈傳說之四：托夢建廟
傳說宋紹興二十七年秋（1157年），莆田城東五里處的白湖這個地方，有章氏、邵氏二族人共夢神指地立廟，隨后驗其地果然是吉地，于是建廟，第二年廟建成。宋紹興三十年，海寇侵擾，百姓到廟里祈禱，忽然狂風大作，海浪滔天，敵畏懼而退。后來又來侵犯，再次顯靈威，很多敵寇被官軍擒獲。
媽祖顯靈傳說之五：圣泉救疫
傳說宋紹興二十五年（1155年），興化一帶發生瘟疫，無藥可治，媽祖托夢給白湖一村民，說離海邊不遠的地下有甘泉，喝了可以療愈疫病。第二天群眾前去控掘并取水飲用，果然靈驗。消息傳開后，遠近人都來取水，絡繹不絕，染疫的人全都得救了，這口井被譽為"圣泉"。
媽祖顯靈傳說之六：神女搭救
傳說北宋宣和初年，莆田人洪伯通有一次航行在海上，突然遇到颶風，帆船差一點覆沒，急忙呼神女搭救，喊聲剛剛結束，大海突然風平浪靜起來，洪氏躲過了滅頂之災。
媽祖顯靈傳說之七：神女救船
傳說北宋宣和五年，宋朝派使者率船隊出使高麗（今朝鮮），在東海上遇到大風浪，其中八條船沉了七條，只剩下使者所乘的船還在風浪中掙扎，忽然船桅頂上閃現一道紅光，一朱衣女神端坐在上面，隨即風平浪靜，使者所乘的船轉危為安。使者驚奇，船上一位莆田人告說是湄洲神女搭救。
媽祖顯靈傳說之八：保護使節
據記載，鄭和七次下西洋中，3次是船隊遇到海寇掠奪和受到錫蘭山國王亞烈苦奈兒陷害；1次是船隊為蘇門答刺國生擒；3次是船隊在海上遇到颶風和險情。每次都說得到媽祖神靈庇護而脫險。
媽祖顯靈傳說之九：天妃神助
據記載，永樂七年，欽差尹璋出使，同年欽差陳慶等往西洋；永樂十三年，欽差內官送甘泉于榜葛剌國，同年太監王貴等又奉命往西洋；洪熙元年（1425年）乙未，欽差內官柴山往琉球；嘉靖十一年（1532年），欽差給事中陳侃等人往琉球冊封；嘉靖三十七年，復遣郭汝霖等出使；均得天妃神助而安全往返。
媽祖顯靈傳說之十：庇佑漕運
據記載，道光六年（1826年），江南有一只千余艘的漕運船隊，一日船隊抵達黑洋，遭到風暴，得到媽祖神靈護助，整個船隊二、三萬人安然無恙。
媽祖顯靈傳說之十一：官員脫險
據記載，康熙四十二年（1703年），御史孟劭前往臺灣巡視，在海上遇到颶風，得媽祖神佑而脫險；乾隆二十五年（1760年），漳州鎮總兵奉命南巡時，河流橫急，遇到險情，得媽祖顯應而平安無事。
媽祖顯靈傳說之十二：庇佑致勝
參考有關資料：1）康熙十九年（1680年），水師提督萬正色駐守崇武，夜夢神妃佐風，于是進兵，迫鄭軍舍廈門入臺灣；2）乾隆五十二年（1787年），欽差大臣福康安等赴臺，返回至大擔時迷失航向，得神火引導而順返；3）乾隆五十二年，張均等率水兵剿海賊，遇風得神助，脫險并擒賊五十余名；4）嘉慶十一年（1806年），官軍在鹿耳門賴媽祖佑助，擊敗蔡牽；5）道光二十一年（1841年），侵華英軍駐進上海潮州會館，裸臥天后神前，夜里夢見受到棍擊，個個驚喊救命。
媽祖顯靈傳說之十三：使節脫險
據有關資料，康熙二年（1663年），張學禮等往琉球國，歸舶過姑米山遇風暴；康熙二十二年（1683年），冊使汪輯等出使，歸舟遇颶風；康熙五十八年（1719年），冊使海寶等奉命赴琉球冊封存，歸舟遇旋風；乾隆二十年（1755年），冊使全魁于姑米山遇臺風；道光十九年（1839年），冊使林鴻年等赴琉球途中兩次遇風暴。均得媽祖顯靈庇佑而脫險。
媽祖顯靈傳說之十四：旱情解難
據記載：1192年夏，閩地干旱嚴重，瘟疫蔓延，群眾向媽祖祈求保佑，禱天即下雨；嘉定十年（1217年），興化大旱，百姓祈求于媽祖，神示夢下雨之時，果然靈驗；寶祜元年（1253年），莆、泉大旱，兩地共禱于神，旱情即除。
媽祖顯靈傳說之十五：神助修堤
據記載，1239年，錢塘江決堤，江水漫到艮山天妃宮時，水勢倒流不前，百姓借勢筑堤，大家都說是神力捍御；寶祜四年（1256年），又得媽祖神助建筑浙江錢塘江堤。
媽祖顯靈傳說之十六：神助擒寇
據記載，乾道三年，海寇侵擾，官兵數次圍殲都無法得手，后憑媽祖神助獲勝。嘉定十年，海寇再次犯境，官兵又得媽祖神助，擒蔻首而勝。景定三年（1262年），海寇作亂于興、泉、漳之間海域，官兵得到媽祖神助，在莆田湄洲一帶海域擒獲海寇。
媽祖顯靈傳說之十七：神助宋師
傳說嘉定元年（1208年），金兵聚集在淮甸一帶，宋廷興師北伐，向媽祖祈禱神助，宋朝軍隊三戰三捷，解了合肥之圍。
媽祖顯靈傳說之十八：護助剿寇
傳說淳熙十一年（1184年），福建都巡檢姜特立奉命征剿溫州、臺州一帶海寇，臨戰前官兵乞媽祖神靈護助。戰時隱約看見神在云端之上，于是乘風進兵，擒獲賊首，大獲全勝。