日本橫濱中華街媽祖廟是海外傳播媽祖文化最早的國家之一，迄今已有600多年歷史，其最大媽祖廟位于橫濱中華街。該廟香火鼎盛，人氣興旺，已成當地華僑華人乃至日本民眾心靈寄托。

日本第二大城市橫濱，是從一個小漁村迅速發展成著名港口城市。1850年，橫濱開港，引來世界各國商人，許多中國人亦飄洋過海來此，或當歐美商人幫手，或從事貿易、開店、打工，逐漸在該市中區下町一帶形成居住區，建起中華街，距今已有150多年了。如今，橫濱中華街已是全日本最大唐人街，東、西、南、北門分別建有朝陽、延平、朱雀、玄武四座牌樓，宏偉古樸；區內店鋪達600余家。每年光顧中華街的達1800萬人次，比東京迪斯尼樂園還多，且絕大多數是日本人，為橫濱市最聚人氣的寶地之一。

中華街媽祖廟始建于2005年3月。當時橫濱僑界組織斥資10億日元，從日本一著名房地產公司購回相關地皮，專門用于興建全日本最大媽祖廟，由日本華裔、橫濱中華街建筑總設計師中山嚴先生擔綱設計，不僅與中華街整體建筑和諧統一，而且參照海峽兩岸媽祖廟規制，采用中國傳統宗教建筑八角形風格。

該廟整座建筑為兩層混凝土結構，占地980平方米，土木工程由日本建筑會社負責；廟內外雕刻裝飾和工藝安裝，則由8位來自媽祖故鄉福建的工藝師和4位來自臺灣的技師完成；而建設所用的特色材料不少是從海峽兩岸專程購運來的。甚至連廟內相關設置和管理機制，亦參照兩岸媽祖廟模式，總投資達18億日元。充分體現中華媽祖文化傳統特色。

2006年1月，橫濱僑界組團專程赴媽祖故里湄洲島，由媽祖祖廟法師為訂造完工的媽祖主神像、分神像及100尊小神像舉行分靈開光儀式，隨后一路虔誠恭護回橫濱。3月8日，媽祖主神像在業已告竣的中華街媽祖廟正殿安座入住。

同年3月17日，中華街媽祖廟隆重舉行落成慶典，中國駐日使館總領事于淑媛、僑務領事李輝、日本橫濱市市長中田宏與日本各地華僑華人社團、中華街各界代表近千人出席。中田宏市長特地致辭祝賀，他說，為保持中華街整體特色，橫濱市決定放棄原興建高層公寓計劃，用來建設對弘揚媽祖及中華文化具有特別意義的媽祖廟。媽祖是中華文化中的海神，而橫濱也是海港城市，希望媽祖也能保佑橫濱。

慶典儀式上，該廟理事會九位理事人人身著藍色中式長袍，向媽祖神像行三叩九拜大禮，虔誠敬獻主香，祈愿天后娘娘保佑僑民僑社平安吉祥。當地中華學校學生還表演富有中國南方特色的獅子舞，廟內外人潮如涌，鞭炮鑼鼓聲此起彼伏。儀式結束后，人們爭先恐后進廟燒香朝拜媽祖。

自此，媽祖廟成了橫濱中華街又一地標性建筑，更是日本弘揚媽祖文化最大信仰中心。